quickQrtPCR | 一个辅助计算qRT-PCR相对表达量的shiny APP

发布网友发布时间：1小时前

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热心网友时间：2024-10-23 07:22

quickQrtPCR是一个实用的shiny应用程序，专为实时荧光定量PCR（qRT-PCR）实验分析设计，旨在帮助科研人员快速计算不同样本中基因的相对表达量。该APP基于shiny、tidyverse和ggpubr技术构建，操作简便，只需导入包含Ct值的Excel文件，即可得到经过2-ΔΔCt方法计算出的相对表达量数据，极大地简化了实验数据处理的流程。

安装quickQrtPCR需要先确保R环境中安装了devtools包，然后通过devtools进行下载和安装。一旦安装完毕，只需调用quickQrtPCR::run_app()即可启动应用程序。界面设计简洁，包括Home界面和功能界面，后者支持多种配色方案的调整以满足个性化需求。

在进行显著性检验时，APP提供了t.test和wilcox.test两种选项，用户需要指定对照组样品名称（通常为CK）以及与输入文件列头一致的样本名。此外，web版本的quickQrtPCR也便于访问，登录nongxinshengxinapp.shinyapps.io可以使用全部功能。

获取更多详细信息，英文文档可在github.com/nongxinsheng...查阅，中文文档则可在农心生信工作室的微信公众号找到。若你对quickQrtPCR有所利用，别忘了在适当场合引用其来源，以示支持。