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northern blot 实验为什么要做内参对照

发布网友 发布时间:2022-05-10 21:16

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1个回答

热心网友 时间:2023-11-01 12:13

Western Blot
为什么必须要用内参

要检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,首选方法是
Western Blot

因为
Western
Blot
操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相
对变化。虽然,顺利的时候
Western
Blot
做起来很简单,可不顺的时候也很令人心烦――做不出结
果啦、假阳性啦、结果出现多条带啦、到底是一抗有问题还是二抗有问题啦……毕竟,作为一种有
活性的生物大分子,抗体和抗原的反应毕竟不象
1+1
那么明确,而用这种不确定的试剂来测定同样
知之甚少的表达产物,确实是有一定的不确定性的。所以,严谨的
Western
Blot
实验设计中要求有
良好的参照体系,对实验结果分析是非常有用。特别是当实验出现问题时,借助参照体系很容易就
可以查出问题所在,
而不必抓耳挠腮怨天尤人。
良好的参照体系通常包括
分子量
Marker
(用来确定
蛋白条带对应的分子量大小)
,空白载体对照(如果是诱导表达体系还应该有诱导前的对照)

已知
量标准产物的正对照

另外还有
内参

可是由于经费*或者偷懒的原因,
国内的不少人做
Western
Blot
往往省略参照,导致结果出现问题时无法分析结果――即便有结果也可能影响结果的分析。

内参是最容易被忽略的一项。我们知道,要用
Western
Blot
比较不同条件下或者不同组织中,目的
蛋白表达量的相对多少,
前提条件是等量的细胞上样,才有比较的基础
。特别表达量不高时,上样
量误差就很可能影响结果的分析。所以你需要内参。

内参
即是内部参照(
Internal
Control

,对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由
管家基因编码表达的
蛋白
(Housekeeping
Proteins)
,它们
在各组织和细胞中的表达相对恒定
,在检测蛋白的表达水平变化
时常用它来做参照物。在
Western
Blot
实验中,除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样
电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外,
还需要进行内参的检测,以校正蛋白质定量、上
样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性


在国外发表的文章中,
Western
Blot
实验结果须进行内参校正已成为一种惯例。但是,国内仍有不
少科研人员在
Western
Blot
实验中忽略了内参的使用,将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种
样品间上样量等同的唯一方法。然而各种蛋白质浓度定量方法,都存在局限性,不能完全准确的确
定各种样品的准确蛋白浓度。如
UV
法直接定量,适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质,相对
于比色法来说,操作简单,但是容易受到平行物质的干扰,如
DNA
的干扰;且敏感度低,要求蛋白
的浓度较高。比色法测定蛋白浓度一般有
BCA

Bradford

Lowry
等几种方法。
BCA
法与
Lowry

都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。
Bradford
法敏感度最高,
且与一系列干扰
Lowry

BCA

应的还原剂(如
DTT
,巯基乙醇)相容。但是对于去污剂依然是敏感的,其最主要的缺点是不同的
标准品会导致同一样品的结果差异较大,无可比性。另外,蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上
样,此步骤也存在操作误差。

Western Blot
实验时使用内参,即可简便地对定量和上样步骤产生
的误差进行校正。
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