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一个处理IVIM,ADC,DKI数据的SPM模块

发布网友 发布时间:2023-02-13 10:33

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热心网友 时间:2023-06-25 01:52

IVIM,ADC和DKI是弥散磁共振图像的三个弥散模型,并已广泛应用于胸腹部脏器的研究中。然而,针对这三种模型的软件网上几乎找不到。为了解决这个问题,本人写了一个spm模块,专门用于处理这三种模型的数据。之所以写成spm模块,是因为spm里面提供了NIFTI数据的读写和其他操作功能,另外spm模块可以非常方便的进行批处理。

使用 mricron 软件中的 dcm2niigui.exe ,将图像转换成FSL/SPM8(4D NIfTI nii)。得到一个4D的DWI图像,和记录b值的bval文件,bval文件后缀给成.txt。

ADC和DKI的输入参数与IVIM相比参数会少一些。具体输入什么数据可以参考IVIM。

IVIM输出的是一个4D的参数文件,第四维度分别是 D, S0,f, Dstar 。 [4]
ADC输出一个后缀为 _ADC.nii 的文件。
DKI每一个参数会输出一个文件,后缀分别是 _D.nii 与 _K.nii 。
下面介绍一下如何提取IVIM的参数值:
将生成的参数图像导入到 ITK-SNAP 软件中,在下图箭头所指的地方点击,选择 2/4 ,也就是显示S0图像,这个图像通常解剖位置清晰,可以用来勾画ROI。勾画想要计算的区域。勾画完成后,选择 Segmentation , 选择 Volumes and Statistics ,在弹出的窗口中,就会显示ROI内每个参数的数值。

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