发布网友 发布时间:2022-04-28 16:56
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热心网友 时间:2022-06-19 20:22
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的反应体系中分别加入普通的dNTP以及4种不同的ddNTP(比如体系1里面缺少dATP,而有ddATP,以此类推)。假设四个体系中分别加入的是ddATP, ddGTP, ddCTP和ddGTP我们就分别把这个叫做A,G,C,T体系,然后每个体系中,会在遇到相应碱基的时候停止反应,这样就产生了一系列长度不一并且分别在以A,G,C,T时终止的DN*段,比如A体系中的DN*段,都是以A结尾的DNA 。接着我们拿着这些片段去进行一个高分辨率的电泳(能够区分出一个碱基的差别),然后根据电泳结果,我们就能读出序列了。追答酶切是为了片段化基因组DNA,无论是第一代还是第二代测序法,他们都不能在一个反应中完成很长的测序反应。所以需要把DN*段化成一定长度(200-300bp左右),然后来测序的。对于以前没有完成过测序的物种,需要用不同的方式来片段化再进行测序,将几套测序结果的数据综合后,用特定的算法来拼接序列。现代第二代测序和第一代测序法最大的不同是,第一代测序法能够同时进行的测序反应数目有限,而且必须在反应完成后再进行序列读取。而二代测序法则是同时进行数百万以上的测序反应,并且边反应边测序。所以效率很高。所以酶切反应无论是一代测序法还是二代测序法,都是必要的过程。在二代测序技术普及以后,测序本身不是很耗时间的事情,耗时间的就是后期的一个序列拼接,不过这个都是由计算机来完成的,相对于一代测序法其实也不算很耗时间。
热心网友 时间:2022-06-19 20:23
那时还是12年前,用的sanger法,6国合作的。成本极高。现在基本用hiseq,454了。sanger只是辅助和验证。组装软件也非常的多。杂体的组需要建文库辅助WGS