首先，惠州站是惠州市的主要火车站之一，位于市区中心。它是一座历史悠久的火车站，拥有较为完善的设施和服务，为乘客提供较多的出发和到达目的地的选择。惠州站连接着广州、深圳等主要城市，也有一些长途列车经过该站。

而惠州南站是惠州市的新建火车站，位于市区南部的陈江镇。惠州南站主要服务于广深城际高铁，是广深线上的一个重要中途站。该站的建设是为了缓解惠州市区火车站的客流压力，并提供更加便利快捷的出行选项。

总的来说，惠州站是惠州市的主要火车站，连接更多的城市和线路，而惠州南站主要服务于广深城际高铁，提供更加便利的交通选择。