拓扑结构分析软件Topos Pro使用教程
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发布时间：1小时前
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时间：2024-12-12 17:37
步骤一：启动Topos Pro软件，选择功能栏中的Database - Import。
步骤二：选择保存的化合物CIF文件，点击Open。
步骤三：软件将CIF文件转化为Topos Pro文件（.cmp），弹出对话框后点击Open。
步骤四：创建需要分析化合物的数据库，点击Yes。
步骤五：提示编译化合物代码，从1开始，点击OK。
步骤六：成功转换化合物文件后点击OK。
步骤七：选择化合物名称，名称变为蓝色填充。
步骤八：选择Run AutoCN（快捷键：Crtl + N），配置并运行。
步骤九：计算原子间成键和氢键相互作用，完成计算后选择Data - Save Data。
步骤十：选择Run IsoCryst（快捷键：Crtl + I），绘制化合物结构。
步骤十一：调整原子颜色，显示原子编号，调整化合物名称，选择Adjacency Matrix查看化学键和氢键相互作用。
步骤十二：将烯烃类配体用氢键与金属离子分割开，将C-C键转换为氢键。
步骤十三：重新绘制结构，观察金属链，将重复单元分割成同类原子重复单元。
步骤十四：重新绘制结构，直至结构不再延展，检查分割单元。
步骤十五：关闭绘图界面，选择化合物名称，点击Run ADS图标。
步骤十六：配置ADS界面，点击Run，创建化合物数据库，编译化合物编号。
步骤十七：选择Whole Molecule，绘制简化好的拓扑结构，检查连接关系。
步骤十八：配置ADS界面，计算简化好的拓扑学结构的符号和连接关系。
步骤十九：保存分析好的数据为txt文件，关闭ADS界面。
步骤二十：输出拓扑结构的CIF文件，绘制拓扑结构图。
