PBJ|植物突变体数据库构建

发布网友发布时间：2024-10-19 14:38

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热心网友时间：2024-12-05 04:51

在2023年10月的《Plant Biotechnology Journal》上，一篇名为“大规模全外显子组测序突变体资源，推动小麦功能基因组学研究”的文章揭示了一项重要的研究成果。六倍体小麦，作为主要粮食作物，其庞大的基因组（约14.4 Gb）带来了基因组学研究的挑战。研究者通过全外显子组测序，生成了一个包含18,025,209个由EMS、碳离子束或γ射线诱导突变的小麦突变体数据库，旨在促进功能基因组学研究和植物科研界的便利。

在Jing411小麦品种中，研究人员鉴定出了2162个突变株系，通过PacBio和Illumina测序技术，发现它们包含了17,649,717个SNPs、442,110个插入、406,601个缺失和68个大片段缺失。这展示了全外显子组测序在分析小麦功能基因突变中的潜力。通过突变体群体，研究人员能够高效定位影响农艺和生物学重要性状的基因，例如利用yg1突变体研究，确定了与黄绿叶表型相关的基因位于2D染色体上。

研究还涉及了赤霉素生物合成和信号通路的反向遗传学鉴定，通过检测纯合突变株系，推测了基因功能。创建的公共数据库（jing411.molbreeding.com...）汇集了这些突变信息，用户可以方便地查询特定基因的突变影响、注释和变异详情，为小麦的基础和应用研究提供了强大的在线工具。这一工作不仅为反向遗传研究提供了宝贵资源，还简化了正向遗传分析步骤，助力小麦功能遗传学的深入研究。