TCGA数据分析(1)---数据下载

发布网友发布时间：2024-10-23 22:37

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热心网友时间：2024-11-06 11:29

TCGA数据库，由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所于2006年共同启动，致力于探索36种癌症类型的分子机制，利用大规模测序等先进技术。

访问TCGA官网以获取相关资源。

TCGA涵盖多种癌症类型，从这一项目中我们能深入理解癌症的分子生物学特性。

通过R语言，TCGA数据下载操作简便，例如stad.gdc_2022.rda数据集内包含胃癌转录组counts、tpms等信息，以及丰富的临床数据。

手动在TCGA网页上下载数据同样可行，适合定制化需求。

下载TCGA数据是数据分析的起点，这些数据包括转录组counts、tpms等，以及临床信息，为后续的基因表达差异分析、通路富集等研究提供了宝贵资源，为实验设计与探索指明方向。