分子检测领域文章分享
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发布时间：2024-09-17 08:41
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时间：2024-09-29 20:00
《Toehold Switches: De-Novo-Designed Regulators of Gene Expression》是哈佛大学尹鹏教授在2014年发表在Cell期刊上的文章，题目为《Toehold Switches: De-Novo-Designed Regulators of Gene Expression》[1]。文章介绍了一种新型的Riboregulator——Toehold Switch。这种Riboregulator与传统的Riboregulator类似，包含两个部分——Switch RNA和Trigger RNA。但其设计和结构有所不同，将RBS元件放在Switch RNA的hairpin结构的loop区，将AUG放在茎区，在编码基因与茎区之间添加了一段Linker。当Trigger RNA与Switch RNA特定区域互补配对，打开Switch RNA的二级结构，暴露RBS，启动下游基因表达。实验显示，Toehold Switch的检测灵敏度高，且没有交互性问题。作者还对Toehold Switch进行多次优化，提升ON/OFF比值，使其性能更优异。在多种场景下，Toehold Switch被用于细胞内基因表达调控和RNA检测。
《Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components》是MIT的James J. Collins在2016年发表在Cell上的文章，题目为《Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components》[2]。文章以应对2016年爆发的寨卡病毒为目标，提供了一种基于Toehold Switch技术的快速廉价检测方法。作者设计了一套工作流程，让研究人员可以利用计算机辅助设计、筛选Toehold sensor，并进行合成、分发和储存。整个检测流程在3小时内完成。文章还介绍了两种Toehold Switch系列（Series A和Series B），分别以LacZ为报告基因，其设计基于不同的二级结构形成机制。实验结果显示，大部分sensor能够检测到300nM浓度的底物，等温扩增方法显著提高了检测灵敏度。文章还讨论了assay的特异性、便携式电子设备的开发及其在不同病毒RNA分子精确诊断中的应用。最后，文章展示了NASBA技术在检测寨卡病毒血浆中的应用。
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时间：2024-09-29 20:02
《Toehold Switches: De-Novo-Designed Regulators of Gene Expression》是哈佛大学尹鹏教授在2014年发表在Cell期刊上的文章，题目为《Toehold Switches: De-Novo-Designed Regulators of Gene Expression》[1]。文章介绍了一种新型的Riboregulator——Toehold Switch。这种Riboregulator与传统的Riboregulator类似，包含两个部分——Switch RNA和Trigger RNA。但其设计和结构有所不同，将RBS元件放在Switch RNA的hairpin结构的loop区，将AUG放在茎区，在编码基因与茎区之间添加了一段Linker。当Trigger RNA与Switch RNA特定区域互补配对，打开Switch RNA的二级结构，暴露RBS，启动下游基因表达。实验显示，Toehold Switch的检测灵敏度高，且没有交互性问题。作者还对Toehold Switch进行多次优化，提升ON/OFF比值，使其性能更优异。在多种场景下，Toehold Switch被用于细胞内基因表达调控和RNA检测。
《Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components》是MIT的James J. Collins在2016年发表在Cell上的文章，题目为《Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components》[2]。文章以应对2016年爆发的寨卡病毒为目标，提供了一种基于Toehold Switch技术的快速廉价检测方法。作者设计了一套工作流程，让研究人员可以利用计算机辅助设计、筛选Toehold sensor，并进行合成、分发和储存。整个检测流程在3小时内完成。文章还介绍了两种Toehold Switch系列（Series A和Series B），分别以LacZ为报告基因，其设计基于不同的二级结构形成机制。实验结果显示，大部分sensor能够检测到300nM浓度的底物，等温扩增方法显著提高了检测灵敏度。文章还讨论了assay的特异性、便携式电子设备的开发及其在不同病毒RNA分子精确诊断中的应用。最后，文章展示了NASBA技术在检测寨卡病毒血浆中的应用。
