拓扑异构酶DNA拓扑异构酶催化反应
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发布时间:2024-08-19 19:08
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时间:2024-08-22 21:44
拓扑异构酶是一种特殊的酶,其核心作用在于通过断裂DNA的磷酸二酯键,进而改变DNA链环数,这使其兼具DNA内切酶和DNA连接酶的特性。它们在反应过程中,断裂与连接是紧密相连的,不能独立进行。对于拓扑异构酶(包括Ⅰ型和Ⅱ型),其工作原理可以用符号转化模型来解释,如图所示(左中)。
除了拓扑异构酶,一些能够插入DNA碱基间的试剂,如片状的染料分子,也能影响DNA拓扑状态。例如,溴化乙锭(ethidium bromide)就是一个典型例子。以SV40的CCC分子为例,未加入染料时,DNA呈现负超螺旋,沉降常数为21S。当染料分子与核苷酸的比例为0.05时,DNA变为松弛状态,沉降数减小至16S;随着染料比例增加到0.09,DNA恢复正超螺旋,沉降常数再次接近21S。这一过程在右图中清晰体现,但需注意,溴化乙锭并未改变Lk值,而是通过染料分子的嵌入,增强了DNA局部二级结构的紧密程度。随着染料分子的增加,负超螺旋先减少直至消失,随后正超螺旋逐渐增多,这与单链DNA结合蛋白的作用类似,都是通过改变结构来影响DNA状态。