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基因组测序有哪些策略

发布网友 发布时间:2022-05-09 21:50

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热心网友 时间:2023-10-23 05:03

提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DN*段(0.2~5Kb),加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通过Paired-End的距离可进一步组装成Scaffold,进而可组装成染色体等。组装效果与测序深度与覆盖度、测序质量等有关。常用的组装有:SOAPdenovo、Trimity、Abyss等。
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