NCBI使用教程3:基因序列的比对

发布网友发布时间：2024-10-12 13:27

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热心网友时间：2024-10-13 06:36

NCBI的基因序列比对工具BLAST是序列相似性查询的强大工具，由美国国立生物技术信息中心开发。它通过与公开数据库中所有序列进行本地匹配，揭示DNA或蛋白质序列的相似性。这种相似性可以用百分比或其他量化标准来衡量，比如A和B序列的80%相似度。

序列比对的核心在于比较研究序列与已知库中的特征，以识别其生物属性。常用的工具包如BLAST和FASTA提供这样的功能，通过两两序列比较算法进行。进行比对时，结果的评价通常依据几个关键指标：Score（匹配得分）、E值（随机匹配概率）、一致性（Identities，匹配碱基数的百分比）以及Gaps（插入或缺失的标记）。

在使用BLAST进行实际操作时，首先访问其网页（https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi），输入比对序列和相关参数。分析BLAST结果时，E值接近零表示高匹配度，Identities则揭示序列的精确匹配程度，Gaps则是比对过程中的差异区域。

以上就是关于NCBI基因序列比对的详细教程，包括目的基因查找、QPCR引物设计等基本操作，你已经掌握了么？