PI3K-AKT通路专题解析(下)
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发布时间:2024-10-11 02:07
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时间:2024-11-29 09:07
基迪奥生物的微信公众号“基迪奥生物 #跟周老师一起学KEGG通路”已经收录了KEGG的系列文章。
想要了解更多KEGG文章的同学可以前往基迪奥生物(gene-denovo) 公众号查看专题。
在上一篇文章《PI3K-AKT通路专题解析(上)》中,周老师介绍了PI3K-AKT信号通路的基本信息、KEGG通路中的位置、通路结构、核心步骤和PI3K激酶二聚物。本期将继续介绍PI3K的上游通路、AKT/PKB以及PI3K-AKT信号的下游,并附有一篇基迪奥合作客户的相关案例解析。
PI3K的上游通路包括多种信号传导过程,如Toll-like受体、B细胞受体、JAK/STAT等。这些上游信号可以来源于多种生长因子和信号传导复合物,例如成纤维细胞生长因子、血管内皮生长因子、表皮生长因子、人生长因子、血管位蛋白I和胰岛素等。
RTK是最大的一类酶联受体,它既是受体,又是酶,能够同配体结合,并将靶蛋白的酪氨酸残基磷酸化。RTK在没有同信号分子结合时以单体存在,并且没有活性。一旦有信号分子与受体的细胞外结构域结合,两个单体受体分子在膜上形成二聚体,激活它们的蛋白激酶功能。
AKT/PKB作为一种原癌基因,在*各种不同细胞功能方面发挥重要作用。AKT的上游激活剂PDK1可以在AKT的苏氨酸308位点将其磷酸化,导致AKT的部分激活。除了PDK1之外,AKT还可以被其他一系列基因*。
PI3K-AKT信号的下游包括mTOR、VEGF、MAPK、糖酵解/糖原异生、FoxO、细胞周期、细胞凋亡、NFκB、P53等众多通路。
基迪奥客户的一篇环状RNA翻译的文章以环状RNA circ-AKT3为例,介绍了明星分子相关基因筛选以及机制研究的逻辑。
通过转录组测序结果锁定明星基因AKT3的环状剪切形式hsa_circ_0017250,证明circ-AKT3可以翻译一个174个氨基酸的多肽。体内外研究显示,AKT3-174aa蛋白通过竞争性结合,抑制激酶PDK1对AKT3的活化效应,从而负*PI3K/AKT信号通路,抑制脑肿瘤的发生发展。
关于KEGG,值得讨论学习的地方太多了。KEGG相关视频将会在OmicShare的主题系列课《和周老师一起学KEGG通路》长期提供点播。