什么是Genbank,它的主

发布网友发布时间：2024-10-04 09:27

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热心网友时间：2024-10-31 02:15

GenBank是一个由美国国立卫生研究院(NIH)维护的基因和蛋白质序列数据库，它集中收录并详细注释了所有公开的核酸和蛋白质序列。每个记录代表一个单独、连续的DNA或RNA片段，并附有注释信息。它的起源可以追溯到60年代初的蛋白质序列收集，随后在1982年欧洲分子生物学实验室(EMBL)创建了核苷酸数据库，引发了数据库增长的热潮。GenBank与日本的DDBJ和EMBL合作，遵循国际DNA序列数据库合作计划的规定，共同管理和更新数据。CDS（编码序列）大部分是通过DNA序列推导出的，依赖于实验、计算和序列比对，提供了对蛋白质功能的推测。数据库包含原始数据和附加信息，如FASTA格式的序列，广泛用于生物学软件包。GenBank还提供NCBI的信息检索系统，如Entrez，用于访问和分析这些数据。每个记录有其独特的ACCESSION和gi号码，后者标识核苷酸序列，当序列更新时，gi号会变，但检索号不变。记录还包括定义、关键词、来源、物种信息、引用、作者、标题、期刊等详细元数据。