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rDNA微生物鉴定

发布网友 发布时间:2024-10-03 02:47

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热心网友 时间:2024-10-20 09:20

在生物技术的快速进步中,传统的微生物鉴定方法面临识别复杂微生物的挑战,因此基于基因组序列的分子鉴定方法日益受到重视。16S rDNA基因,因其在细菌基因组中的进化保守性、适宜分析长度及变异性,成为细菌分子鉴定的理想序列。研究者利用16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的保守区域设计引物,对两种创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(IGS)进行了PCR扩增并克隆到pGEM-T载体上。通过BLAST和DNAstar软件,对测序结果进行了详细的比较分析。


分析结果显示,两株创伤弧菌共检测出9种IGS类型,如IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG,每个类型都包含不同数量的tRNA基因。其中,ZSU006菌株测出的序列中IGSGLAV最长,包含多种tRNA基因;而CG021菌株缺少IGSA,但其余类型与ZSU006相似。与GenBank数据库中的ATCC27562创伤弧菌比较,发现不同IGS类型的tRNA基因非编码区在种内具有较高同源性。这种差异揭示了16S-23S rDNA间区的结构对于开发创伤弧菌检测新方法的重要性。


在番茄减数分裂粗线期和有丝分裂中期染色体的显带分析中,采用CPD染色法发现了独特的染色体特征。粗线期染色体上显示10条CPD带纹,有丝分裂中期染色体则有12条,且两者带纹具有对应性。利用番茄45S rDNA克隆进行的荧光原位杂交,显示了特定的染色体识别标记,尤其是随体和部分粗线期或中期染色体区域。然而,来自小麦的45S rDNA克隆pTa71的杂交信号仅限于随体,这暗示了番茄基因组中仅随体含有45S rDNA编码区,即番茄只有一对45S rDNA位点。




扩展资料

rDNA,即核糖体DNA。rDNA 就是可以转录产生rRNA的基因,rDNA的活性改变在核仁周期(也就是细胞分裂过程中核仁的消失与重建)中发挥着重要作用。它不是单独存在的,有时候它可以和别的基因间隔分布,比如可以和tDNA间隔。

热心网友 时间:2024-10-20 09:18

在生物技术的快速进步中,传统的微生物鉴定方法面临识别复杂微生物的挑战,因此基于基因组序列的分子鉴定方法日益受到重视。16S rDNA基因,因其在细菌基因组中的进化保守性、适宜分析长度及变异性,成为细菌分子鉴定的理想序列。研究者利用16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的保守区域设计引物,对两种创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(IGS)进行了PCR扩增并克隆到pGEM-T载体上。通过BLAST和DNAstar软件,对测序结果进行了详细的比较分析。


分析结果显示,两株创伤弧菌共检测出9种IGS类型,如IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG,每个类型都包含不同数量的tRNA基因。其中,ZSU006菌株测出的序列中IGSGLAV最长,包含多种tRNA基因;而CG021菌株缺少IGSA,但其余类型与ZSU006相似。与GenBank数据库中的ATCC27562创伤弧菌比较,发现不同IGS类型的tRNA基因非编码区在种内具有较高同源性。这种差异揭示了16S-23S rDNA间区的结构对于开发创伤弧菌检测新方法的重要性。


在番茄减数分裂粗线期和有丝分裂中期染色体的显带分析中,采用CPD染色法发现了独特的染色体特征。粗线期染色体上显示10条CPD带纹,有丝分裂中期染色体则有12条,且两者带纹具有对应性。利用番茄45S rDNA克隆进行的荧光原位杂交,显示了特定的染色体识别标记,尤其是随体和部分粗线期或中期染色体区域。然而,来自小麦的45S rDNA克隆pTa71的杂交信号仅限于随体,这暗示了番茄基因组中仅随体含有45S rDNA编码区,即番茄只有一对45S rDNA位点。




扩展资料

rDNA,即核糖体DNA。rDNA 就是可以转录产生rRNA的基因,rDNA的活性改变在核仁周期(也就是细胞分裂过程中核仁的消失与重建)中发挥着重要作用。它不是单独存在的,有时候它可以和别的基因间隔分布,比如可以和tDNA间隔。

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