发布网友 发布时间:2022-04-26 16:49
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热心网友 时间:2022-05-07 01:32
首先,要辨别PCR污染的来源,是环境污染,还是PCR反应液的污染?
设立阴阳性对照,有利于检测反应体系各成分的污染情况。尤其是设立空白对照,这对检测试剂中PCR产物残留污染是非常有益的。
在排除试剂污染的可能性,并更换试剂后,若不久又发现试剂被污染了,则考虑可能为环境污染。环境污染的最主要原因是DNA溶液的溅出和DNA气溶胶造成的实验区域的污染,这在PCR产物扩增区尤其容易出现。移液器*头和EP管架是比较常见的污染部位。
如果是环境污染,还可对每个区域进行涂抹采样和核酸提取,以最终鉴定污染的区域所在。
对PCR的环境污染,有如下几种治理方法:
1、用常规消毒液定期在环境中喷雾消毒处理。
2、 稀酸处理法:对可疑器具用1mol/L盐酸擦拭或浸泡,使残余DNA脱嘌呤;此方法缺点是盐酸对皮肤有一定的腐蚀性。
3、紫外照射法:紫外波长一般选择254—300nm,照射30分钟至2小时。但需要注意的是,UV照射仅对500bp以上长片段有效,对短片段效果不大。
4、 选用商品化的DNA污染祛除剂。推荐Minerva公司的PCR CleanTM 喷雾剂、湿巾。其1分钟即起效,方便快捷,效果显著,可同时去除DNA和RNA。作用1分钟后,用纸巾擦拭,即可完成对DNA污染的清除。
对于PCR反应液的污染,可采取以下方法:
1、 DNase I法:PCR混合液(未加模板和Taq聚合酶)加入0.5U DNase I,室温条件下反应30min后加热灭活,然后加入模板和Taq聚合酶进行正常PCR扩增。
2、 内切酶法:选择识别4个碱基的内切酶(如MspI和Taq I等),可同时选择几种,以克服用一种酶只能识别特定序列的缺陷,室温作用1h后加热灭活再进行PCR试验。
3、紫外照射法:对未加模板和Taq聚合酶的PCR混合液进行紫外照射,注意事项与方法同上述UV照射法。
4、 尿嘧啶糖苷酶(UNG)法:用dUTP代替dTTP,使PCR产物中掺入大量dU。再次进行PCR扩增前,用UNG处理PCR混合液即可消除PCR产物的残留污染。由于UNG在PCR循环中的变性一步便可被灭活,因此不会影响含dU的新的PCR产物。
热心网友 时间:2022-05-07 02:50
一、污染监测