protscale的结果得出每个氨基酸的亲水输水数值,怎么确定是什么氨基酸呢?
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发布时间:2023-06-30 18:08
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时间:2023-10-12 20:18
Protscale是一种通过氨基酸序列计算亲水性或疏水性的工具,其结果输出是对于氨基酸序列中每个氨基酸的亲水/疏水性的预测值。一般情况下,预测的亲水性/疏水性值越高,代表该氨基酸越亲水/疏水。因此,可以根据输出结果中亲水/疏水性值的大小来确定每个氨基酸的亲水/疏水性,常见的氨基酸亲水/疏水性排序如下:
亲水性(高到低):R, K, E, D, Q, N, H, S, T, Y, C, W, A, G, M, I, L, V, F, P
疏水性(高到低):W, F, Y, M, L, I, V, C, A, T, G, S, P, H, E, Q, N, D, K, R
在使用Protscale时,需要根据具体研究问题来选择适合的参数设置,并且结合生物学知识和实验结果来解释结果。