做miRNA的预测怎么从数据库选取已知的miRNA及其靶基因，新手求教，最好详细的说下操作步骤，多谢了

发布网友发布时间：2022-04-25 14:23

共3个回答

热心网友时间：2023-10-08 23:28

如果是要初步的筛选，最好用至少3个数据库进行预测，然后取共有的target gene进行下一步的验证，常用的数据库有targetscan，RNA22，mirbase，PITA，microcosom等等

热心网友时间：2023-10-08 23:28

我来晚了一点。如果着重于已知miRNA-靶基因对，targetscan并不适用。推荐两个网站提供此类信息：
http://diana.cslab.ece.ntua.gr/DianaToolsNew/index.php?r=tarbase/index
http://www.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk/index.html

热心网友时间：2023-10-08 23:29

targetscan这个网站不过上面都是预测的靶基因 mirbase上有已经报道证实的靶基因

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