9.5 GWAS显著SNP筛选及曼哈顿图绘制

发布网友发布时间：2023-09-17 05:53

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热心网友时间：2024-12-02 03:23

在R中进行整理，pmap格式在下面帖子中有详细介绍。第一列为SNP的ID，第二列为chr，第三列为SNP的位置，第四列开始为每个性状的SNP的P值。
9.3 GWAS：关联分析——EMMAX - (jianshu.com)

9.4 GWAS：显著性阈值确定——GEC - (jianshu.com)
阈值 = 显著性/有效SNP数

即在此性状中，没有显著的SNP。

函数解释同 9.3 GWAS：关联分析——EMMAX - (jianshu.com)

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