没有完整的ORF是完整的基因么?如何设计引物

发布网友发布时间：2022-04-24 17:18

共3个回答

热心网友时间：2023-10-25 12:31

拼接的cDNA序列结果有可能会出现各种各样的情况，没有完整的ORF的话建议你去blast一下基因组序列（如果你所做的物种的基因组已经测的差不多的话），如果在基因组中能定位到的话就去用基因预测软件预测基因组上的基因并找到外显子，再拼出全长ORF，
如果没有基因组信息那就只能去做5'RACE和3'RACE了，如果能RACE出来经过测序鉴定和你接拼的序列一样说明这个基因确实是存在的，如果RACE不到可能就是假基因，不过如果你是从EST库中拼出来的应该不会是假基因，假基因不会存在于EST库中。祝研究成功

热心网友时间：2023-10-25 12:32

不一定，可能是pseudogene，也有可能就是你没有找到终止密码子而已
你设计引物是要克隆这个基因吗？如果只是测表达的话，根据ORF来设计就好了，如果要克隆，还是先做一个RACE确定一下ORF的末端再做吧

热心网友时间：2023-10-25 12:32

你想要全长是吧，你做了EST—blast的话，只能找已发表的全序列比对，肉眼估计Mat和PolaAAA ,然后在这附近设计引物，扩吧。
顺便鄙视上面回答的，RACE 有几个学生做的起。