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碱裂解法制备质粒dna时,溶液1,2,3中各组分都起什么作用

发布网友 发布时间:2022-04-30 15:02

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热心网友 时间:2022-06-25 21:10

碱裂解法制备质粒DNA时,溶液Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ中各组分的作用:

1、溶液Ⅰ:

葡萄糖是使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,其主要目的是为了螯合二价金属离子从而达到抑制DNase的活性;可添加RNase A消化RNA。

2、溶液Ⅱ

此步为碱处理。其中NaOH主要是为了溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的情况下,细胞膜发生了从双层膜结构向微囊结构的变化。SDS与NaOH联用,其目的是为了增强NaOH的强碱性,同时SDS作为阴离子表面活性剂破坏脂双层膜。这一步要记住两点:

第一,时间不能过长,因为在这样的碱性条件下基因组DN*断也会慢慢断裂;

第二,必须温柔混合,不然基因组DNA会断裂。

3、溶液Ⅲ

溶液III的作用是沉淀蛋白和中和反应。其中醋酸钾是为了使钾离子置换SDS中的钠离子而形成了PDS。

因为十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾 (potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是不溶水的,同时一个SDS分子平均结合两个氨基酸,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了。

2 M的醋酸是为了中和NaOH。基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被 PDS共沉淀了,所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然最后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入,琼脂糖电泳可以观察到一条浓浓的总DNA条带。

75%酒精主要是为了清洗盐份和抑制Dnase;同时溶液III的强酸性也是为了使DNA更好地结合在硅酸纤维膜上。

扩展资料

质粒抽提的窍门

(1)加溶液II(裂解液)后,操作一定要温和,剧烈混合会导致基因组DNA污染。

(2)洗脱时60℃温育(Ellution Buffer)洗脱缓冲液或去离子水效果更好。

(3)若质粒提取含量低,可增加菌液样或换用ArtMedia Plasmid Culture,其比LB培养基质粒得量高。

(4)菌体应彻底悬浮 , 如果没有彻底悬浮菌体,则残留的菌体团块在溶液 II 加入后,变成难以完全裂解的团块。这个团块在溶液 III 加入后,会有一部分蛋白质继续存在于溶液中,成为蛋白质残留的最大根源。

(5)加入溶液 II 后,混匀,体系最好能立即变得清澈。体系如果变得清澈了,马上加入溶液 III 中和。

(6)中和的操作 ,在 1.5ml 离心管中加入溶液 III 后,先颠倒两次,使管底朝上,用指头弹击管底数次,再颠倒混匀。效果非常好。

参考资料来源

百度百科-质粒抽提

热心网友 时间:2022-06-25 21:10

加入溶液1的目的主要是将细菌团块重新溶解于缓冲液中;溶液2含有SDS及NaOH,前者可将细菌溶解,后者可将DNA变性;溶液3是由醋酸和钾盐组成,前者在于中和碱性,后者则有利于染色体DNA的沉淀

热心网友 时间:2022-06-25 21:11

碱裂解法制备质粒DNA时,溶液Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ中各组分的作用:
1.
溶液Ⅰ: 葡萄糖是使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,其主要目的是为了螯合二价金属离子从而达到抑制DNase的活性;可添加RNase A消化RNA。
2.
溶液Ⅱ 此步为碱处理。其中NaOH主要是为了溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的情况下,细胞膜发生了从双层膜结构向微囊结构的变化...
3.
溶液Ⅲ 溶液III的作用是沉淀蛋白和中和反应。其中醋酸钾是为了使钾离子置换SDS中的钠...

热心网友 时间:2022-06-25 21:11

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碱裂解法制备质粒dna时,溶液1,2,3中各组分都起什么作用

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大肠杆菌质粒裂解系统

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碱裂解法制备质粒dna时,溶液1,2,3中各组分都起什么作用

碱裂解法制备质粒DNA时,溶液Ⅰ中的葡萄糖成分的主要作用是防止大肠杆菌沉淀,保持其悬浮状态。EDTA的作用是螯合钙离子和镁离子等二价金属离子,从而抑制DNase的活性。此外,可以添加RNase A来消化RNA。溶液Ⅱ是碱处理步骤的关键,其中NaOH的作用是溶解细胞,释放DNA。在强碱性条件下,细胞膜由双层结构转变...

碱裂解法提取质粒时,试述溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ的主要成分及作用原理...

【答案】:(1)溶液Ⅰ的主要成分为葡萄糖和EDTA。葡萄糖能增加溶液的黏度,防止DNA受机械作用而降解。EDTA可螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制DNase对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅助因子)。(2)溶液Ⅱ的主要成分为氢氧化钠(NaOH)和SDS。DNA在pH5~9的溶液中是稳定的,但当pH>12或...

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溶液2中的主要成分是NaOH和SDS,是用来裂解细胞的。因为NaOH遇到二氧化碳容易反应生成碳酸氢钙,影响使用效果,因此要现配现用。SDS的话,低温容易产生沉淀。不过在37°C 水浴一下就好。主要还是NaOH的问题。溶液1主要是让菌体细胞充分悬浊于溶液,没有什么实际意义,可以不要。溶液2是碱液,目的在彻底破坏...

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溶液3是酸性钾盐溶液,其主要任务是中和碱性环境,同时沉淀出SDS。在这个过程中,除了SDS,蛋白和大段线性DNA也会被沉淀。这一步骤对于后续纯化质粒DNA至关重要。从历史角度看,碱裂解法已用于E.coli(大肠杆菌)质粒DNA的提取超过30年。在这个过程中,细胞被置于高pH强阴离子洗涤剂中,破坏细胞壁,让...

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在使用碱裂解法提取质粒DNA的过程中,涉及的溶液有特定的作用和现象:首先,溶液2主要由NaOH和SDS组成,其核心功能是裂解细胞。NaOH的作用在于与二氧化碳反应生成碳酸氢钙,这可能影响提取效果,因此在使用时需现配现用。SDS在低温下容易沉淀,但通过37°C的水浴可以避免。这里的主要挑战在于NaOH的处理。溶液...

质粒提取中每一步的作用

溶液一:重悬菌体,提供缓冲环境。溶液二:氢氧化钠和SDS裂解菌体细胞壁、在细胞膜上穿孔,释放细胞内的质粒。溶液三:中和氢氧化钠、SDS中的钠被钾替换,吸附菌体产生沉淀。复杂的说:让我们先来看看溶液I的作用。任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液,是再自然不过的了...

质粒提取试剂盒中各溶液配方及作用

质粒提取采用碱裂解法,通过不同溶液的协同作用来实现高效分离。首先,溶液P1(组分浓度为25mM Tris-HCl、10mM EDTA、50mM葡萄糖)的主要作用在于悬浮菌体,同时利用Tris-HCl保持pH稳定,EDTA螯合金属离子以抑制DNase活性,葡萄糖增加粘度,延缓菌体沉降。溶液中添加的RNA酶可有效降解RNA杂质,确保后续操作的...

SDS碱裂解法提取质粒DNA中溶液1的成分及作用是什么?

葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。这一步溶液中还可以加入RNase,不受EDTA影响,并且可以在后续步骤中被除去 溶液Ⅱ 0.2M NaOH / 1% SDS 破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。溶液Ⅲ 3M 醋酸钾 / 2M 醋酸 这一步的K置换了SDS(十二...

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