发布网友 发布时间:2022-04-30 03:36
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热心网友 时间:2023-10-09 21:42
基因分型:是指利用数据库中已有的SNP进行特定人群的序列和发生频率的研究,主要包括因芯片技术,Taqman技术,分子信标技术和焦磷酸测序法等。
(一)、基因芯片技术
基因芯片技术:是在固相支持介质上进行分子杂交和原位荧光检测的一种高通量SNP分析方法。
优缺点:
优点是高通量,一次可对多个SNP进行规模性筛选,被捡起始材料也很少,操作步骤简单。缺点是芯片设计成本高,由于DNA样品的复杂性,有些SNP不能被捡起。
(二)、Taqman技术
在pcr反应系统中加入2种不同荧光标记的探针,他们分别与两个等位基因完全配对。探针运用了荧光共振能量转换技术,探针的5’端和3’端分别用特殊染料标记,称为供体-受体染料对或爆-猝灭燃料对。
(三)、分子信标技术
与Taqman技术相似,分子信标技术也是在PCR反应体系种加入荧光标记的探针与靶序列杂交,通过仪器检测荧光值的变化,进行基因分型。
优缺点:
分子信法在选择荧光染料时,不必像Taqman法那样考虑染料之间光谱的重叠性,一次可以使用4种或4种以上染料,同时对多个SNP进行分析。Taqman法和分子信标法优点都是简单操作,可以自动化;缺点是不能达到高通量分析,荧光探针费用高。
(四)、焦磷酸测序法
焦磷酸测序法是一种不依赖平板胶或毛细管电泳,不依赖DNA的荧光标记/激发/检测体系的序列分析技术,适用于已知SNP的序列验证及基因分型。焦磷酸测序法主要是由4种酶催化同一反应体系中的酶级联反应,包括DNA聚合酶、硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶,反应底物为adenosine5’phosphosulfate 和荧光素