primier5缺少文件

发布网友发布时间：2023-11-07 15:38

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热心网友时间：2024-12-05 01:07

Primer的主要功能分四大块，其中有三种功能比较常用，即引物设计（primer），*酶切点分析（Enzyme），基元查找（Motif）。另外功能是同源性分析（Allign），并非premier的特长，在此略过。该软件还有别的一些功能，如序列“朗读”，DNA与蛋白序列的互换（Protein），发声提示键盘输入等，但是其中最优秀的缺失能设计简并引物。

使用步骤：

Premier软件的启动并打开一段序列后，界面如下：

其主要功能在主届面上一目了然（按钮功能如上述）。*酶切点分析以及基元查找比较简单，点击该功能按钮后，选择相应的*酶或基元，按确定即可。常见的*酶和基元一般都可以找到。还可以编辑或者添加*酶或者基元。

进行引物设计是，点击“Primer”按钮，界面如下：

进一步点击“search”按钮如图2，出现search criteria窗口，有多种参数以调整。搜索目的（Seach For）有三种选项，PCR引物（PCR Primers），测序引物（Sequencing Primers），杂交探针（Hybridization Probes）。搜索类型（Search Type）可选择上、下游引物（Sens/Anti-sense Primer）都分别查找）（Both），或者成对查找（Pairs），或者分别以适合上下有引物为主（Compatible With Sense/Anti-sense Primer）。另外还可以改变选择区域（Search Ranges），引物长度（primer length），选择方式（search mode，）参数选择（search parameters）等等。研究人员可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按“OK”，随之出现的search progress窗口中显示的search completed时，再按“OK”。