CRISPR 小讲堂之Cas蛋白
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发布时间:2024-07-03 09:21
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时间:2024-07-20 23:51
在生物科学的璀璨星河中,CRISPR/Cas技术以其卓越的性能,犹如一颗闪耀的明星,短短几年内便赢得了全球科学家的瞩目。张锋、杜德娜与夏邦杰等杰出科学家因此获得了无数赞誉。CRISPR/Cas系统,源于原核生物的天然防御机制,由CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)和Cas(CRISPR-associated)蛋白共同构筑。这个大家族包含丰富多样的Cas蛋白,如Cas1至Cas10,它们根据结构差异,主要分为两大类:I/Ⅲ/Ⅳ型多亚基复合蛋白和Ⅱ/Ⅴ/Ⅵ型单体蛋白系统。
其中,Cas9以其卓越的基因编辑能力而闻名,这是一种DNA内切酶,依赖于向导RNA的PAM(protospacer-adjacent motif)序列,精准地切割DNA,从而引发同源重组或非同源末端连接修复,实现对基因的精细操作。为了让编辑更为精确,Cas9的一个变体——Cas9 nickase(Cas9n,由RuvC I突变D10A或H840A形成),仅在互补链上切割,显著降低了脱靶效应的风险。
Cas9的另一个变体dCas9,则通过sgRNA(single-guide RNA)介导,丧失了切割功能,却能实现靶向结合基因,调控基因表达,这种非永久性的调控手段在基因研究中尤为重要。
Cas12a(Cpf1),作为CRISPR-Cas12a的一员,以其独特的双链断裂切割机制,既应用于基因编辑,又在序列特异性免疫检测中展现威力。而Cas12b(C2c1),以其特定的PAM序列选择性切割,成为了核酸快速检测的得力助手,尤其在温度适应性方面表现出色。
Cas13家族,如Cas13a(C2c2)专为RNA剪切而设计,适用于RNA检测和多重靶向RNA操作。Cas13b的多功能性使其在RNA编辑领域大显身手,而Cas13d凭借其高效性、低脱靶率和小型化设计,成为了病毒载体递送的理想工具。Cas14家族的成员,如Cas14a,虽以其单链DNA切割能力非典型,但在DETECTR诊断技术中扮演了重要角色。
近岸公司等机构,提供包括Cas9突变体、LbaCas12a、LwaCas13a等CRISPR-Cas蛋白,以及T7EI工具酶和sgRNA合成工具包,为科研工作者们提供了丰富的选择。深入研究CRISPR技术的分子检测、CRISPR-Cas系统的分类,以及CasPDB数据库,将有助于我们更全面地理解这些基因编辑工具的奥秘与应用潜力。