发布网友 发布时间:2024-02-10 10:42
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热心网友 时间:2024-02-10 13:35
转录组研究技术主要有的如下:
1、表达序列标签技术:
通过PCR方法检测细胞在特定生理条件下表达的基因。
2、全长转录组测序技术:
能够检测细胞中所有基因的表达情况。
3、表达量分析技术:
主要用于定量分析基因的表达水平,其中qPCR是一种常用的技术。
4、序列比对法:
利用同源序列比对参考基因组上已知的基因的CDS序列来鉴定特定物种的基因。
5、差异表达分析:
通过RT-PCR、qPCR等方法比较两个样本组之间某一特定基因的表达差异。
6、RNA-Seq:
通过高通量测序技术,反映RNA的表达水平。
7、基因表达系列分析技术:
是一种高通量、大规模的基因表达分析技术。
8、微阵列技术:
用于大规模基因组表达谱研究、快速检测基因差异表达。
转录组简介与分类:
转录组简介:
广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。在整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录*规律的学科。从RNA水平研究基因表达情况,特定的细胞、个体、组织在特定状态下转录出所有RNA。
不同生长发育时期不同。与基因组学区别,转录组是在特定的时间特定组织状态下转录出来的,不同的时间状态转录出来的RNA是不同的。转录组学是分子生物学的分支,负责研究在单个细胞,或特定类型的细胞,组织,器官或发育阶段的细胞群内所生产的各类RNA分子的类型和数量。
分类:
真核有参有基因组序列或注释信息可以查询:LncRNA CircRNA (lnc和circ需要参考基因组比对 SmallRNA 全转录组真核无参:SmallRNA原核转录组(需要参考基因组)判断是否有参考基因组,可以在各大数据库里查找,比如NCBI。