linux系统用blast序列比对用什么文件建库
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发布时间：2022-04-11 05:30
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时间：2022-04-11 06:59
2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln
-s /home/username/blast/bin；
3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入export
PATH=/home/username/bin/=$PATH;
4、在当前目录下，将数据文件格式化，$formatdb -i
filename.后缀 -p F -o T
5、将待进行blast的文件转化为test.txt文件，拷贝文件内容如下：
>test....
ACGTCAGTCGATCGAT.....
6、进行比对
$blastall -p
blastn -d filename.后缀 -i test.txt -o test.out
