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测序双峰什么情况

发布网友 发布时间:2023-12-20 09:39

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热心网友 时间:2024-03-09 00:08

样品本身被污染,这常常发生在样品为质粒和菌液的情况中.当使用通用引物测序时,如果刚好和样品中的几个质粒均能结合,那么就会出现这种情况,而且在同一位置上还可能有不止两个峰形;样品不是单一模板,这常常发生在样品为PCR产物的情况中.由于使用的是特异性引物,因此即使模板中有其他DNA的存在,产生干扰的可能性也很小.通常是由于存在两条分子量很接近,采用琼脂糖电泳无法分开的条带,在测序时就会发生这种情况; 样品中存在两个引物结合位点,这常常发生在样品中存在重复序列的情况下.当引物恰好设计在重复序列中时,那么在重复序列以外的部分就会出现Twopattern的情况;所用的测序引物不纯,这种情况一般发生在PCR产物测序中.因为PCR测序一般使用的都是PCR扩增引物,如果引物本身不纯,测序结果会出现双峰.所以我们测序的引物一般要求都是要经过PAGE纯化的;测序样品序列中存在如重复序列,poly结构,发夹结构等复杂结构导致测序信号出现乱峰.
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