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westernblot内参GAPDH成功了

发布网友 发布时间:2022-12-20 05:04

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热心网友 时间:2023-09-24 20:44

2019-01-09 星期三 晴

说起昨天,真的很心酸。虽然以前看过同门大致做了一遍,但许多细节还是不清楚的。自己亲身体验才清楚。。。
1.蛋白测定之后要加5X SDS上样缓冲液,该怎么加呢?是所有的标本一起加了,还是就算准备上样的量?经中心试验室CWW指点后才知道,可以一起加了。就是把蛋白样品的体积除以4就是了,这样的5Xbuffer就变为了1X。
2.紧接着是配胶,也是一堆问题。过硫酸铵(AP),给我的是一支0.5g干粉,说明书说配成10%溶液,我先是拿1mlDDW稀释,然后去了100ul在稀释成1ml。结果依据产品说明书的要求配置分离胶,过了一个消失还是不能凝固。多方求教之后才发现AP,只有5%(Oh,my god!)。于是再取了100ul加入AP溶液中,这下就解决问题。 在配胶过程中,分离胶和浓缩胶所使用的SDS浓度是不一样的。一个1cm的胶,可能需要5ml的制胶液体。
3.配胶归配胶,分离胶的玻璃板如何安装才能不漏液也是一门技术活。我没有提前去把玻璃板清洁,只是临时把玻璃板清洗、擦干、再吹干。(这浪费了许多时间,故建议有自己专属的玻璃板,后者提前准备好。)在安装玻璃板的时候,要准备剥离板的底端要齐整,然后扣在制胶架上,要将绿色的卡夹下压到底,这样才能密切贴合。不然就像我那样,胶(前面提高胶不会凝固)就从缝隙里流光了。有人建议可以在剥离板上涂一些凡士林,有减少漏液的功效。
4.好不容易把胶制好了,开始跑电泳。电泳内槽也开始漏液,真是急死人了。(这时候,老病号的电话打过来了,之前和他约好11点的时候见面,安排复查事宜。两个事情堆在一起急死了。)肾内科的老师LLL建议我把电泳槽灌满电泳液,就没办法漏了,一开始想是个好办法,后来想想把胶重装一遍吧。在重装的过程中确实发现了问题所在,原来内槽上面有一个类似台阶的小疙瘩,之前没有注意到,没有将它配齐,故而留有缝隙,漏液了。于是针对性地重装了一遍,内槽不漏液了。开始电泳。电泳显示选择60V跑浓缩胶,跑了大概十分钟,发现没有啥动静,也没有传说中的泡泡冒出。认真核实了一下电路,没有接错之后,就赶紧去处理老病号的事情。临走之前还让麻醉的小兄弟JZT帮我瞄一眼。这位小兄弟一本正经地和我说,短路了。这可把我吓了一跳,赶紧电话追过去。原来他所谓的短路,是电泳内槽水漏没了。我十分悲伤地放下了电话,抱怨今天白忙活了。等我回到实验室,打开盖子,惊喜地发现电泳内槽水是满的。也发现了marker条带出来了。就是时间很久。大概过了一个消失,终于把分离胶跑完了。开始跑分离胶,设置100V,又过了一个小时,分离胶才跑了三分之一,于是把电压调到120V,又过了一个小时,分离胶才跑了三分之二。眼瞅着下午五点了,而且内参的条带已经出来了,索性把电压调到了150V,没到半小时,就跑完了。
5.转膜。电泳的过程相对比较顺利。不过切胶也切了我大半天,犹豫怎么下手就花了10分钟,现在想来,就是目标条带的判断准确之后,先切去浓缩胶和不要的孔道,然后切去剩下的分离胶。剪PVDF膜和活化膜,比较顺利。在“三明治”的配置过程中,耽搁了一会儿。一定要切记胶和膜的对应方向,膜上还要做个标记,以便判断蛋白所在的位置。开始电转的时候,已经快七点了,一看protocol要60V电转2小时,当时就有些想放弃了。好在问了一位高手YRL,她建议300mA电转45分钟就可以了。我一听一下子轻松了不少。
6.封闭。5%牛奶封闭了一会儿,直接扔冰箱里了。因为已经体力不支了,所以电脑也没带回去。在这期间我把病理切片的名单写在了载玻片上面,算是弥补了一点原本当天要完成的工作。

今天,早早地过去,就是希望把westernblot的流程完成了。
1.洗膜。1X TBST洗膜,这个我已经提前配置好了,没有压力。5minX3次。
2.孵一抗。按照GAPDH说明书,1:4000稀释一抗。我还以为4ml的一抗稀释液要16ul的抗体。我一想,有点不合理吧。我买的GAPDH总共才25ul,一次性全部用了。好在问了肾内科的LLL,跟我解释了一下。原来是抗体和一抗稀释液的配比是1ul和4000ul,果然这样才合理。就这样开开心心地常温孵化抗体3h。在这期间去了趟病理科,把昨天弄好的病理组织块切回来,准备下一步免疫组化。
3.去完病理科,吃了个午饭,没有休息继续奋斗。到细胞房惊喜地发现放在别人细胞层的140细胞居然一点污点都没有。这是细胞培养箱的问题吗?还是我一直怀疑的培养基问题,抑或是培养液没有提前预热的问题?总之,细胞状态很好,就准备一传三,同时冻存一部分。而这次510又开始一反常态,污点变多了,但没有之前增殖那么快,所以今天510我全部扔了。同时将第一次的510复苏了。希望你要好好的,明天见分晓。
4.回收一抗。(请注意,如果你要回收抗体,建议将抗体在冰上孵育,以保证抗体质量)。TBST洗膜三遍,5minX3次。
5.孵二抗。就简单多了。按说明书1:5000稀释,于是乎,二抗和二抗稀释液的配比是1ul和5000ul,继续常温孵化了2h。回收二抗。TBST洗膜三遍,5minX3次。
4.ECL曝光。今天很幸运,在曝光的时候碰到之前认识的一个小兄弟HMT,还认真地教我一遍,包括具体的方法及其选择事由。这次曝光发现了内参还是比较整齐,其上混有一些杂带。继续找人帮我解决。

于是乎,到今天下午,我总算把WB的流程磕磕碰碰地做了一遍,算是小有结果吧。明天看一下M3的曝光情况。期待明天SZM同学给我带来新的食管细胞109和709。还有继续筹备免疫组化的东西,落实het-1a细胞的状况。。。

附: Elivision二步法免疫组化染色步骤
1 石蜡印片脱蜡和水化后,用PBS(pH7.4)冲洗二次,每次3分钟(3x3min)
2 根据每种抗体的要求,对组织抗原进行相应的修复。
3 如果有必要,每张切片加1滴或50ul的3%H202,室温孵育10分钟,以阻断内原性 过氧化物酶的活性。PBS冲洗3x3·.
4 除去PBS液,每张印片加1滴或50ul第一抗体(用户自选),室温孵育60分钟或4'C 过夜,建议参见每种抗体的说明书。
5 PBS冲洗3x5’。除去PB5液,每张印片加1滴或50ul聚合物增强刑(试剂 A ),室腽孵育20分钟.PBS冲洗3x3.
6 除去PBS液,每张切片加1滴或50ul酶标抗鼠/免聚什物(试剂 B ),室温孵育30分钟。PBS冲洗3x3·.
7 除上PBS液,每张切片加1滴或5Oul新鲜配制的DAB或AEC溶液,显微镜观察3~5分钟( DAB )或10分钟( AEC )。
8 自来水冲洗,苏木素复染,若有必要,可用0.1%HCl分化自来水冲洗,PBS返蓝.
9 如果用DAB显色,则切片经梯度酒精脱水干燥,(二甲苯透明),中性树胶封片,如果用AEC显色,则切片不能酒精脱水, 而直接用水性封片剂。
westernblot内参GAPDH成功了

今天,早早地过去,就是希望把westernblot的流程完成了。1.洗膜。1X TBST洗膜,这个我已经提前配置好了,没有压力。5minX3次。2.孵一抗。按照GAPDH说明书,1:4000稀释一抗。我还以为4ml的一抗稀释液要16ul的抗体。我一想,有点不合理吧。我买的GAPDH总共才25ul,一次性全部用了。好在问了肾...

Western blot 实验大忌——稀里糊涂跑内参蛋白

在科学研究的精密战场上,每一步细节都关乎实验结果的准确性和可靠性。熊叔鸡汤告诉我们,理解原理并作出明智决策是关键。在Western blot实验中,选择合适的内参蛋白如同管家基因,能够确保表达的标准化和实验的稳定性。内参蛋白:实验的稳定锚点 内参蛋白的重要性不言而喻,它们是衡量实验正常性的指标,协助...

GAPDH有什么作用

GAPDH在生物学研究中发挥着重要作用,特别是在Western blot蛋白质标准化过程中。作为内参蛋白,它的存在使得科学家们能够准确地比较不同样品中目的蛋白的相对含量。GAPDH全称为甘油醛-3-磷酸脱氢酶,是糖酵解途径中的关键酶,由四个30-40千道尔顿的亚基组成,总分子量为146千道尔顿,检测时会在36千道尔顿...

GAPDH和GAPDHS的区别是什么?

GAPDH的特性在于其在几乎所有组织中高表达,作为管家基因,它的蛋白含量在同种细胞或组织中相对恒定。这就使得它在Western blot等蛋白质分析中成为理想的内参,通过比较样品中目的蛋白与GAPDH的含量,我们可以精确地评估样品间的蛋白表达变化。内参蛋白的科学价值 内参蛋白,或称为内部参照,是实验中用来校准...

GAPDH基因的检测原理是什么?

GAPDH基因几乎在所有组织中都高水平表达,广泛用作Western blot蛋白质标准化的内参。因为GAPDH 作为管家基因在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的,因此在使用GAPDH内参抗体时,将每个样品测得的目的蛋白含量与本样品的GAPDH含量相除,得到每个样品目的蛋白的相对含量,然后才进行样品与样品之间的...

western blot等生物学试验中的内参是什么意思

内参是指用于比较和归一化实验结果的参考物质。在生物学试验中,内参通常是一种已知含量或者稳定表达的蛋白质或RNA,用来标准化同一实验中不同样品的数量差异。例如,在western blot实验中,内参可以是乳腺癌细胞中常见的丰度相对稳定的蛋白质如β-actin或GAPDH。通过将目标蛋白的信号强度除以内参的信号强度,...

Western Blot实验三个常见内参选择指南:GAPDH、Tubulin还是Actin...

Western Blot实验中内参蛋白的选择是关键,常见的有GAPDH、Tubulin和Actin。GAPDH,作为糖酵解过程中的关键酶,分子量36kDa,表达稳定但可能在特殊条件下如缺氧、糖尿病时变化,不推荐这些情况下的内参。Actin,尤其是β-actin,作为细胞骨架蛋白,42kDa,广泛存在于真核细胞中,适合全细胞和细胞质样品标准...

gapdh内参基因贴抗体

Gapdh内参基因贴抗体的应用非常广泛,主要包括以下几个方面:定量PCR:qPCR是测定Gapdh表达水平最常用的方法之一,使用Gapdh内参基因贴抗体既可以作为PCR反应的内参控制又可以用于检测Gapdh的表达水平;免疫印迹:Westernblot也是常用的检测蛋白表达量的方法之一,使用Gapdh内参基因贴抗体可以作为蛋白质的内参控制,...

Western Blot为什么必须要用内参

Western Blot为什么必须要用内参 要检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,首选方法是Western Blot。因为WesternBlot操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。虽然,顺利的时候WesternBlot做起来很简单,可不顺的时候也很令人心烦――做不出结果...

gapdh分子量大小gapdh分子量是什么

1、gapdh分子量是:146 kDa。2、GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)是参与糖酵解的一种关键酶,由4个30-40kDa的亚基组成,分子量146kDa,检测条带大约在36kDa。3、GAPDH基因几乎在所有组织中都高水平表达,广泛用作Western blot蛋白质标准化的内参。4、因为GAPDH作为看家基因在同种细胞或者组织中的蛋白...

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