单细胞数据信噪比(Signal-to-noise ratio,SNR)

发布网友发布时间：2022-10-16 21:43

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热心网友时间：2023-10-24 08:36

信噪比，英文名称叫做SNR或S/N（SIGNAL-NOISE RATIO)，又称为讯噪比。是指一个电子设备或者电子系统中信号与噪声的比例。这里面的信号指的是来自设备外部需要通过这台设备进行处理的电子信号，噪声是指经过该设备后产生的原信号中并不存在的无规则的额外信号（或信息），并且该种信号并不随原信号的变化而变化（百度百科）。这是在其他领域的定义，当然，作为生物信息学研究者来说，这个定义并没有什么生物学价值，接下来我们运用SNR来解决一点我们生物学的问题。
现在单细胞技术处于一个很火的阶段，相信很多人都有很多单细胞的分析数据，当然分析方法也有很多，大家值得借鉴的分析方法更是让人“眼花缭乱”，这次我们就来运用信噪比来解决我们的生物学问题，运用到这个方法的文章是《Obesity remodels activity and transcriptional state of a lateral hypothalamic brake on feeding》，大家感兴趣可查阅一下，这里我们直接来到信噪比（SNR）的分析部分。
首先第一步我们要知道信噪比是比较信号和噪音之间的比值，用在生物学上就是比较处理组和对照组之间的“信噪比”，我们来看文章中运用到的步骤：
Comparisons of gene expression levels between groups were performed on inverse hyperbolic sine (asinh) transformed data。
For gene x,
asinh fold-change (asinhFC) was defined as: