R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换
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发布时间：2022-11-23 14:58
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时间：2024-07-29 01:16
ID转换用到的是 bitr() 函数，bitr()的使用方法：
org.Hs.eg.db包含有多种gene_name的类型
keytypes()：keytypes(x)，查看注释包中可以使用的类型
columns()：类似于keytypes()，针对org.Hs.eg.db两个函数返回值一致
select()：select(x, keys, columns, keytype, ...) eg.
函数enrichGO()进行GO富集分析，enrichGO()的使用方法：
举例：
R包 clusterProfiler: GO和KEGG富集结果显示基因symbol
3)检查结果，可见geneID展示为gene symbol。（1）在enrichGO函数中，设置readable = TRUE;(2)用setReadable函数，对GO或者KEGG结果进行转化即可。
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