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如何看QRT-PCR 结果中的Cq值

发布网友 发布时间:2022-04-28 22:02

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2个回答

热心网友 时间:2022-06-23 16:50

这样算:

你先把几次试验的对照组的平均值设为1, 再把每个单独试验对照组的数值算出和这个对照组平均值的差异,就可以计算标准差了。

这么简单的统计分析,用不着SPSS吧, excel就可以解决了。
追问 : 谢谢您,可是我还是有点不明白:如果我重复三次,每次3个复孔(即一共9个孔),您指的“把几次试验的对照组的平均值设为1”是指把对照组的ΔCT还是ΔΔCT还是2的-ΔΔCT的平均值设为1啊?谢谢!

追答 : 首先,你重复做一个样本(3个重复的孔),那只能算一个值(取平均)。 我说的1是指的相对表达量,不是ΔCT。你得到每个样本中目的基因和内参的CT值后,就可以算出相对表达量了,对不对? 这时,取所有对照组的平均值,设为1. 每次实验的对照组再和这个平均值1比较,就是对照组的标准差了。

追问 : 您所说的目的基因和内参的CT值相减得到的不就是ΔCT吗?假设三次实验某一基因的对照组的均值为4,5,6,则均值为5,此时把5设为1,然后再怎么算啊?不好意思麻烦您再解答一下,非常感谢

追答 : 按照你说的,5为平均值,那三个组分别和5比较,不就是-1, 0, 1三个值吗。得到的相对表达量就是0.5, 1 和2. 不管是CT值还是表达量,你都可以算出标准差,做出error bar了。

追问 : 我知道了,可是这样出来的error bar好大啊,给人感觉误差会很大呀

追答 : 这个error bar反应的是真实的差异啊,怎么会给人误差很大的感觉呢,我只是举了个例子,实际上你只要加样量控制的好,对照组的误差都是很小的。不会出现4, 5, 6这样的差异,一般都是在小数点后的差异

热心网友 时间:2022-06-23 16:50

新版的软件都叫Cq值,不叫Ct值了,不必理会。Ct值15-25是最好,10-30之间也接受。如果超过30了,得看一下复孔是否一致,如果一致,也接受。如果不一致,基本就是废的。
如何看QRT-PCR 结果中的Cq值

新版的软件都叫Cq值,不叫Ct值了,不必理会。Ct值15-25是最好,10-30之间也接受。如果超过30了,得看一下复孔是否一致,如果一致,也接受。如果不一致,基本就是废的。

qRT-PCR相对定量分析,你学会了吗

qRT-PCR基于cDNA模板通过荧光信号实时监测扩增过程,Ct值代表荧光信号达到预设阈值的循环数。实验中,扩增曲线评估引物效率,理想的是一次性峰值,保证结果准确性。而 Livak法的步骤如下:计算对照组(wt)和处理组(mut)的内参基因(如ATCB)Ct值均值。计算目标基因(OCA2)的Ct值与内参基因的差值(...

qrt pcr 各个参数的意义

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qRT-PCR中标准曲线制作及浓度梯度问题

反转录的时候按照试剂盒的要求转录特定质量的RNA(RNA的浓度可以通过分光光度计测定),反转完后按照推荐的比例稀释产物即可,一般确保你要的基因的Ct值在20~25比较理想 对于同一类生物样本,提取三份RNA(每份RNA都应包含若干不同的生物个体)并反转录,分别Q,这叫生物学重复;Q同一个基因的时候平行3...

请教qRT-PCR数据统计问题

这样算:你先把几次试验的对照组的平均值设为1, 再把每个单独试验对照组的数值算出和这个对照组平均值的差异,就可以计算标准差了。这么简单的统计分析,用不着SPSS吧, excel就可以解决了。

qrt—pcr数据如何分析?使用2—δδt计算出倍数差异之后,如

判断数据之间的显著性差异。在选择分析方法时,需根据研究的具体需求与数据类型进行判断。例如,问卷研究中,若比较类别为两组,可使用独立样本T检验或单因素方差分析。若比较类别超过两组,尤其是涉及多个因素时,方差分析更为合适。T检验与卡方检验各有专长,适合不同类型的分析需求。

qRT-PCR的数据处理问题,error bar应该怎么做?

现在我想自己把数据整出来之后用excel或者graphpad之类来做柱状图,但是现在不知道error bar应该怎么做,我仔细看了下仪器的分析结果,好像它的error bar用的是RQ max和RQ min,所以请问一下,这里的error bar难道不是用SD么?我的SD是用目的基因CT减去内参CT之后的值计算的,高的时候有0.23。但是用SD...

定量方法知多少--绝对定量

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从新冠病毒检测方法,学习qRT-PCR实验及数据分析

设计引物时,需遵循特定原则,如利用保守区设计,保持特异性。引物长度在17-25个碱基之间,G+C含量在40%-60%之间,TM值在58-62度之间。避免引物间的二聚体和自二聚体、发卡结构,以保证扩增特异性与效率。通过oligo 7等软件检测引物的二级结构,确保无不良结构。扩增效率检测是确保qRT-PCR结果准确性...

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