生物信息学在线工具gorilla执行go富集分析有没有多重假设检验矫正
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发布时间:2022-04-29 16:11
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热心网友
时间:2023-10-18 10:30
在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?
P值是啥
P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。
纠正p是啥意思
通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。*座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。
对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。
因此有一种校正的方法就是p<0.01/10^n;不过这种纠正过于严格,会丢掉超级多的真阳性。因此现在更多的是FDR校正,Bonferroni校正等。
是什么时候需要矫正呢
建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。
多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。
希望可以帮到你。
热心网友
时间:2023-10-18 10:30
在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?
P值是啥
P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。
纠正p是啥意思
通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。*座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。
对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。
因此有一种校正的方法就是p<0.01/10^n;不过这种纠正过于严格,会丢掉超级多的真阳性。因此现在更多的是FDR校正,Bonferroni校正等。
是什么时候需要矫正呢
建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。
多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。
希望可以帮到你。
热心网友
时间:2023-10-18 10:30
在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?
P值是啥
P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。
纠正p是啥意思
通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。*座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。
对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。
因此有一种校正的方法就是p<0.01/10^n;不过这种纠正过于严格,会丢掉超级多的真阳性。因此现在更多的是FDR校正,Bonferroni校正等。
是什么时候需要矫正呢
建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。
多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。
希望可以帮到你。
热心网友
时间:2023-10-18 10:30
在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?
P值是啥
P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。
纠正p是啥意思
通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。*座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。
对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。
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建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。
多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。
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时间:2023-10-18 10:30
在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?
P值是啥
P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。
纠正p是啥意思
通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。*座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。
对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。
因此有一种校正的方法就是p<0.01/10^n;不过这种纠正过于严格,会丢掉超级多的真阳性。因此现在更多的是FDR校正,Bonferroni校正等。
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建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。
多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。
希望可以帮到你。