mtdna的限制性内切酶分析为什么基因组dna不行
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发布时间:2022-05-16 19:31
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时间:2024-02-29 21:52
1)购买的*性内切酶 带有两种不同的酶切缓冲液,该用哪一种
每种*性内切酶 带有一管酶的最适反应液(通常是一种4-CORE反应液),可能还带有一只MULTI-CORE反应液。
2)4-CORE酶切缓冲液体系是什么
大多数(大约75%)Promega公司的*性内切酶 有一种最适酶切缓冲液,即4-CORE酶切缓冲液,分别叫作A、B、C和D。其余的25%的*性内切酶带有一种特定的酶切缓冲液(酶切缓冲液E-L)。每一种*性内切酶带有一只最适酶切缓冲液。
3)MULTI--CORE酶切缓冲液体系是什么
MULTI--CORE酶切缓冲液适用于双酶切。每一种Promega公司的*性内切酶 都测试了在MULTI--CORE酶切缓冲液中的活力,如果酶切活力达25%,就提供一只MULTI--CORE酶切缓冲液。作双酶切时,如果两个酶在MULTI--CORE酶切缓冲液中的活力达到50-100%,就可替代A-L酶切缓冲液。应选用酶活力最高的酶切缓冲液。
4)如何保存*性内切酶
不太常用的*性内切酶多保存在-70oC,每周或每天用的酶保存在-20 oC。有一些酶需要不同的保存条件。每一种Promega公司的*性内切酶都提供一份分析说明以供查讯。使用*性内切酶时,应将酶保存在冰上。
5)一般的*性内切酶反应中(也叫消化),应用多少内切酶
所用的酶量取决于DNA的纯度、量和型态。*性内切酶的活力单位定义为在适当的温度下,在1小时内,1ugDNA在50ul体积中,被完全消化所需的*性内切酶的量。一般说来,线性DNA比超螺旋DNA更易消化。比如,酶切1uglambdaDNA,需要1-2单位的酶,而酶切1ug质粒DNA,需要3-5单位的酶。
6)使用*性内切酶的一般步骤是什么
一般步骤如下:
A)测试酶切DNA的量
B)计算完全酶切所需的酶量。为使终体积中甘油的浓度低于8%,计算能加的酶量,最多能加终体积的10%(甘油的浓度为5%)。
C)10X反应液的体积应为终体积的1/10;10X反应液的体积不应小于酶的体积。
D)加入计算好的DNA,10X反应液,酶。
加入水到终体积(20-50 ul),轻轻混匀,在适当的温度下保温。一般酶的最适温度为37 oC,但有例外。应查讯分析说明。
比如:
质粒DNA (2ug/ ul) 5 ul
10X反应液 5 ul
酶(5ug/ ul) 5 ul
dH2O 35 ul
50 ul
37 oC保温2-3小时。
应最后加酶。
7)一次使用两个*性内切酶的一般步骤是什么(比如双酶切)
一次使用两个*性内切酶的一般步骤,如同使用一个*性内切酶的一般步骤。但要注意两个*性内切酶在同一种缓冲液中都要有活力。甘油的浓度不应超过终体积的8%。应注意有些酶对末端敏感,活力差。
8)能否在一次反应中用很多的*性内切酶
可以,一般而言,甘油浓度超过8%对酶切有抑制。有些酶在高的甘油浓度中会产生星活力。*性内切酶提供在50%的甘油中,故10 ul反应体积中不应加入超过1.6 ul的酶。
9)消化反应中是否需要加牛血清白蛋白(BSA)
不需要。酶切不需要加BSA。但Promega公司的*性内切酶活力测定时,均加入乙酰化的BSA达0.1mg/ml。BSA可以提高许多*性内切酶活力。Promega公司的*性内切酶均提供一管乙酰化的BSA(R396D,E,F),并建议酶切时加入BSA达0.1mg/ml。
10)星活力是什么
星活力是指在保温条件改变,如NaCl过多存在于反应液中,使酶切的核酸序列不同于它特定的识别序列。
11)什么是同切酶
同切酶指两个酶的识别位点和酶切位点相同,如SphI(CGTAC'G)和BbuI(CGTAC'G)互为同切酶。
12)什么是neoschizomer
Neoschizomer指两个酶的识别序列相同,但酶切位点不同,如SmaI(GGG'CCC)和XmaI(G'GGCCC)互为neoschizomer。
13)基因组规格指的是什么
基因组规格的酶适用于酶切包裹在琼脂中的基因组DNA。另外,染色体DNA的制备、酶切和凝胶分离的条件对基因组规格的酶作了优化。
14)如果一个*性内切酶不是基因组规格,是否表明它不能用于处理染色体DNA
不一定。如果一个*性内切酶不是基因组规格,Promega公司没有测试它能否处理包裹的基因组DNA。因此需作一些测试来决定酶是否会切割底物。
15)需要用多少单位的*性内切酶对琼脂包裹的染色体DNA进行酶切
切割包裹的DNA比普通底物需要更多的酶,一般需要多2倍。