RPM和FPKM转换

发布网友发布时间：2022-05-15 07:38

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热心网友时间：2023-10-13 23:46

RPM/CPM:Reads/CountsofexonmodelperMillionmappedreads(每百万映射读取的reads)，FPKM:FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments(每千个碱基的转录每百万映射读取的fragments)而RPM的计算公式：RPM=totalexonreads/mappedreads(Millions)FPKM(推荐软件，cufflinks/Stringtie)和RPKM(推荐软件，Range/Deseq)的计算方法基本一致，公式如下(外显子的表达)：RPKM=totalexonreads/(mappedreads(Millions)*exonlength(KB))

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