做gwas时每个snp的p值怎么算的

发布网友发布时间：2022-05-15 05:44

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热心网友时间：2023-10-10 11:11

SNP是分布在动物基因组中非常常见的一种分子标记。在人体中每1000bp就可能有一个SNP。需找SNP的目的是为了做连锁分析，在现在先进的技术里，还可以做全基因组关联分析（GWAS）。

然后说说标签SNP，这个涉及到单倍型的问题（对单倍型稍微讲解一下！三个SNP假定是G、C突变，G、T突变和A、T突变，但不是说这些突变在单倍体染色体上里是随意组合的，而是趋向于一种组合方式，比如一条染色体是GGT,另一条是CCA）。因为在基因组中，有些区域是较为紧密连锁在一起的，这个区域可大可小，组成一个单倍型框，在区域里也会存在多多少少的SNP。人们没有必要把这些SNP都找出来，因为它们往往就像是*在一起的。于是从中选出一个代表性的SNP，它可以反映这个区域的情况。然后就方便人们继续做关联分析！继人类基因组计划之后，还做了单倍型的图谱。这也是标签SNP的应用。讲的够清楚吧，呵呵……希望理解，。